Tous les États modernes disposent d’une institution dont la mission fondamentale est le contrôle des finances publiques.
En République gabonaise, l’existence d’une juridiction financière remonte au lendemain de l’accession du pays à la souveraineté internationale, le 17 août 1960.
Le Président de la Cour Suprême incarnait l’ensemble du pouvoir judiciaire et, à ce titre, était l’interlocuteur privilégié des pouvoirs exécutif et législatif. C’est dans ce contexte que vont progressivement se mettre en place les Chambres de la Cour Suprême. D’abord la Chambre Judiciaire, ensuite la Chambre Administrative et enfin la Chambre des Comptes en 1977.
La Chambre Constitutionnelle quant à elle ne verra le jour qu’en 1991 avec son érection en Cour Constitutionnelle.

De 1962 à 1977
- Les attributions de la Chambre des comptes sont assurées par la Chambre administrative (réception du serment des comptables publics uniquement).
De 1977 à 1994
élaboration des textes organiques de la Chambre des comptes :
- loi n° 6/78 du 1er juin 1978 portant organisation de la Justice (cette loi fixe les attributions de la Chambre des comptes) ;
- décret n°540/PR/MJ du 25 mais 1979 fixant l’organisation, le fonctionnement et les règles de procédure de la Chambre des comptes.
De 1994 à nos jours
- Promulgation de la loi n° 7/94 du 16 septembre 1994 portant organisation de la justice qui acte la réforme du système judiciaire du Gabon. La Cour Suprême est supprimée. A la place de celle-ci, émerge trois Hautes Cours placées à la tête de trois ordres de juridictions : Cour de cassation à la tête de l'ordre judiciaire; Conseil d’État à la tête de l'ordre administratif; Cour des Comptes à la tête de l'ordre financier ;
- promulgation de la loi organique n° 11/94 du 17 septembre 1994 fixant l’organisation, la composition, les compétences, le fonctionnement et les règles de procédures de la Cour des Comptes ;
- promulgation de la loi organique n° 003/2022 du 27 avril 2022 fixant l’organisation, la composition, la compétence et le fonctionnement des Juridictions de l’ordre financier composé de la Cour des comptes et des Chambres Provinciales des comptes au nombre de sept (7) pour le moment (Franceville, Mouila, Ntoum, Tchibanga, Koulamoutou, Oyem et Port-Gentil).
Les Présidents de la Chambre des Comptes de la Cour Suprême
- Jean Bernard SAULNEROND MAPANGOU, Administrateur civil en chef (1979-1980) ;
- Dieudonné MOUCKETOU, Magistrat (1980-1983) ;
- Marie Madeleine MBORANTSUO, Magistrat (1983-1991) ;
- Gilbert NGOULAKIA, Magistrat (1991-1994).
Les Commissaires du Gouvernement près la Chambre des Comptes de la Cour Suprême
- Marcel JAMES, Administrateur civil en chef (1983-1987) ;
- Professeur Fidèle MENGUE M’ENGOUANG, professeur des universités (1987-1994).
Les Premiers Présidents de la Cour des Comptes
- Gilbert NGOULAKIA, Magistrat (de 1994 à 2021) ;
- René ABOGHE ELLA (2021 à 2023) ;
- Alain Christian IYANGUI (2023 à nos jours).
Les Procureurs Généraux près la Cour des Comptes
- Léon Démaillord OBIANG, Magistrat (1994-1996) ;
- Alphonse NDJANDJA, Magistrat (1996-2005) ;
- Charlotte MPAGA, Magistrat (de 2005 à 2021) ;
- Joseph MOUGUIAMA, Magistrat (2021 à 2024) ;
- Isabelle RASHIWA EP. ROLAGO, Magistrat, nommée en 2024